使用 Redshift Spectrum 查询 S3 数据

通常使用 redshift 做数据仓库的时候要做大量的 ETL 工作,一般流程是把各种来源的数据捣鼓捣鼓丢到 S3 上去,再从 S3 倒腾进 redshift. 如果你有大量的历史数据要导进 redshift,这个过程就会很痛苦,redshift 对一次倒入大量数据并不友好,你要分批来做。

今年4月的时候, redshift 发布了一个新功能 spectrum, 可以从 redshift 里直接查询 s3 上的结构化数据。最近把部分数据仓库直接迁移到了 spectrum, 正好来讲讲。

动机

Glow 的数据仓库建在 redshift 上, 又分成了两个集群,一个 ssd 的集群存放最近 4 个月的数据,供产品分析,metrics report, debug 等等 adhoc 的查询。4个月之前的数据存放在一个 hdd 的集群里,便宜容量大,查询慢。

但是时间长了 hdd 的集群也是有扩容需求的,而使用频率又实在是不高,其实很浪费, 这就是迁移到 spectrum 的动机。

使用 Spectrum

Redshift spectrum 底层其实是基于 AWS 的另一个服务 athena 的。athena 是个 Presto 和 Hive 杂交产物, DDL 用 Hive 语法, 查询用的 sql 由 Presto 支持, 感觉怪怪的,这里不多展开讲 athena, 知道 redshift spectrum 其实是通过 athena 对接的 s3 就行了。

在 redshift 中创建 external schema

create external schema spectrum_schema from data catalog  
database 'spectrum_db'  
iam_role 'arn:aws:iam::123456789012:role/MySpectrumRole'  
create external database if not exists;  

这里的 data catalog database spectrum_db 其实就是 athena 里的,创建完后可以在 athena 的面板上看到, iam_role 需要提前创建, 用来给 redshift 授权访问 athena.

如果你已经有了一个 hive 的 metastore, 也可以绕过 athena 直接对接 hive, 详情看文档: http://docs.aws.amazon.com/redshift/latest/dg/c-spectrum-external-schemas.html

在 external schema 中创建 external table.

external table 只能创建在 external schema 中,可以外链到 s3, 支持 partition, 每个 partition 就是 s3 上的文件夹。

create external table spectrum.logs(  
user_id integer,  
...
)
partitioned by (_dt date)  
stored as parquet  
location 's3://bucket/partitions/';  

存储在 s3 上的数据我用了支持 columnar 的 parquet 格式,spectrum 支持: avro, parquet, rcfile, sequencefile, textfile. 注意它的 textfile 并不是 csv, 只是简单用 delimiter 分割数据,不支持 escape。

partition 需要一个个手工添加:

Alter table spectrum.logs add partition(_dt='2017-01-01') location 's3://bucket/partitions/_dt=2017-01-01/'

需要注意的是这里的 partition key _dt 是一个虚拟的 column, 你可以在查询的时候用它来过滤数据,但它不能出现在 DDL 的 column 中.

查询就很简答啦: select count(*) from spectrum.logs where _dt='2017-01-01'

使用 parquet 存储数据

parquet 是一种支持 columnar 的格式,在 hadoop 生态圈很常用, 一方面可以在查询的时候只扫描需要的列,大大提高查询速度,另外,spectrum 是按照查询的时候扫描过的数据量收费的(5$/TB), 使用 columnar 的格式可以大大降低成本.

原始数据在 redshift 里,要使用spectrum,需要转存到 s3 上. redshift 里导出的数据是 gzip 压缩的 csv 格式,这里需要做一次转换. 我起了一个 emr 的集群,用spark来转换的,非常方便。

核心步骤就两步,读取 csv 得到 spark 的 dataframe 对象,转存成 parquet 格式到 s3.

schema = StructType(  
[
    StructField('user_id', LongType(), True),
    StructField('event_name', StringType(), True),
    ....
]
)
df = spark.read.schema(schema).option("sep", "|").csv("s3a://bucket/raw/*")  
df.write.option("compression", "gzip").parquet("s3a://bucket/parquet/000.parq")  

几个要注意的点:

  • parquet schema中定义的数据类型要和 redshift external table 定义的数据类型匹配,不然查询会出错, 不支持隐式转换。
  • redshift unload 出来的数据,boolean 字段会用f, t, 表示,spark 不认,所以 schema 对 boolean 字段要先定义成 string,再强制转换成 boolean: df = df.withColumn("col_name", df["col_name"].cast("boolean"))
  • 如果csv 数据字段中有换行符,需要用 "" 引起来,不然即使你 escape 了,spark 的 csv parser 也处理不了.
  • spark 转存 parquet 的时候, 默认使用 snappy 压缩数据,snappy 压缩解压速度都最快,但压缩比比较低,如果你的查询不是很频繁,可以换成 gzip, 体积更小.

Performance

使用 parquet 后,体积进一步减小,原本一个 4 GB 的 gzip 文件,转存成 parquet(压缩还是 gzip), 体积就只有 2 GB.

对一张有10亿行的表中某个字段做个简单的 group by count 操作,在原来的 HDD 集群上要 40s, 在 spectrum 里只要 6s.

综上,把 redshift 里的历史数据搬到 s3 上,用 spectrum 查询,可以减少成本,提高查询速度,还省了 ETL 的步骤.